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酪蛋白膠、大豆蛋白膠營養豐富，儲藏超過1 d以上就必須采取防腐措施。曾經廣泛使用過鄰苯基苯酚鈉、五氯苯酚鈉，其用量為膠粘劑固體成分的3％。但由于五氯酚鈉對人體及環境存在不良影響，該防腐劑已被列入禁止使用的范圍。對羥基苯甲酸的酯類是比較緩和的殺菌劑。氯化甲基異噻唑啉、三丁基亭氧化物、氧化二甲苯酚等也是有效的殺菌劑。
木材膠粘劑防腐的發展趨勢是：①從高毒性向低毒性、無毒性過渡，如五氯苯酚鈉有被對羥基苯甲酸的酯類、新型工業防腐劑BIT等替代的趨勢；②從有機、溶劑型向無機、水溶型過渡，許多對環境柔和的重金屬鹽類如Ag鹽、Zn鹽等用于蛋白質基木材膠粘劑既可發揮防腐效果、又有提高耐水性的效果；③ 從化學防腐向生物防腐過渡。在天然產物中，殼聚糖是制造復合型木材防腐劑的好材料。
