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一、發霉影響防腐木的外觀質量：木材的發霉是由于霉菌侵蝕木材而引起的，危害木材的霉菌屬于子囊菌綱與半知菌綱的真菌，如木酶屬(Trichoderma)、青霉屬(Penicillium)和曲霉屬(Aspergillus)。不同屬別的霉菌的結構形態及其分生孢子的顏色各不相同，因此感染了不同顏色的孢子后在木材表面形成不同顏色的霉斑，如黑、綠、黃紅、藍綠等，影響木材的外觀質量。例如曲霉的黑曲霉產生的孢子成黑色，感染這種孢子的木材表面呈黑色，有時也連成一片。一般，各類霉菌引起的變色如下：木霉菌——變綠、鐮刀菌——變紅或變紫、曲霉菌——變黑、青霉菌——變綠、根霉菌——變黑等。
二、發霉影響防腐木的滲透均勻性：霉菌喜好潮濕的環境，因此沒有經過干燥的原木端頭、板方材、單板等很容易發霉，尤其是闊葉材的邊材部分。木材的發霉通常只限于面層或靠近表面很淺的層，只有在適宜的條件下菌絲才會向內部侵入。菌絲是通過文孔向木材內層侵入的，主要吸收木材內的一些淀粉和糖分等營養物質，對細胞壁幾乎沒有影響，因此通常發霉對木材的強度沒有影響，但是由于紋孔的破壞，所以滲透性有所增強。但是這并非是一個可利用的現象，因為這樣引起的滲透性的提高在木材內并不均勻，如果對這樣的木材經過防腐處理，經常會發現防腐劑在木材內部的分布不均勻的現象。
三、發霉的木材有利于木腐菌的侵害： 藍變或發霉的木材往往有利于木腐菌的侵害，所以木材開始發霉、變色時，應進行防腐處理，加強木材的保管。
四， 如果發霉的防腐木經及時防腐，碳化處理還是可以用的。
